[Q]
一般ユーザでログインしている時に、 su で root になり control-panel を開こうとしてもうまくいかないのですが

[A]
デフォルトでは localhost からの X のアクセスは許可されていないのが原因だと思います。
su で root になる前に
% xhost localhost
で許可をだしてから su で root になり、
$ control-panel
と打てばうまくいきませんか？

[Appendix]
/etc/X0.hosts を使ってあらかじめ許可を出しておくこともできます。



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